(Q)SAR是描述分子结构和效应之间的定量/定性关系的模型或算法,主要依赖于集成在计算机中的模型进行预测,分为规则模型(Rule-based models)和统计模型(Statistic-based models)。
交叉参照是由一个或多个化合物(源物质)的终点信息预测另一个或多个具有相似特征的化合物(目标物质)的同一终点信息的一种非测试方法,通常依赖于人为的专家经验进行预测,分为类似物法(Analogue Approach)和分类法(Category Approach)。
但是在实际应用中,两种预测方法也会相互借鉴,如在(Q)SAR预测中通常也需要引入专家评估,以提高预测的准确性;在交叉参照中也通常会利用化学结构相似性算法,去自动寻找能与目标化合物进行交叉参照的类似物。
总体而言,采用这两种方法进行毒性预测时,(Q)SAR方法更依赖于模型本身,而交叉参照则更依赖于专家经验。